Après une formation de comédien au Conservatoire National Supérieur d’Art Dramatique de Paris, Frédéric Fisbach accompagne les premières années de l’aventure de la compagnie de Stanislas Nordey jusqu’au Théâtre Nanterre-Amandiers. Il crée sa première mise en scène en 1992 au Théâtre Gérard-Philipe de Saint-Denis, Les Aventures d’Abou et Maïmouna dans la lune d’après Bernard-Marie Koltès. À la suite de ce spectacle il fonde sa compagnie l’Ensemble Atopique et devient artiste associé de la Scène Nationale d’Aubusson. En 1994, il monte L’Annonce faite à Marie de Paul Claudel, avant de s’intéresser à Maïakowsky, Kafka, Racine, Corneille et à Strindberg avec L’Île des morts. Lauréat de la villa Medicis hors les murs en 1999, il séjourne au Japon, découvre les arts traditionnels de la scène et rencontre l’auteur dramatique Oriza Hirata, dont il mettra en scène Tokyo Notes et Gens de Séoul. De 2000 à 2002, il est artiste associé au Quartz de Brest, il crée Les Paravents de Jean Genet avec la compagnie de marionnettistes traditionnels japonais Youkiza et Bérénice de Racine avec le chorégraphe Bernardo Montet. Il est ensuite nommé directeur du Studio-Théâtre de Vitry en 2002 puis est codirecteur avec Robert Canterella du Centquatre de 2006 à 2009. Artiste associé du Festival d’Avignon en 2007, il propose pour la Cour d’honneur une installation, performance de trois jours et trois nuits où il convie le public à des conférences, ateliers de pratiques théâtrales et à la représentation de Les Feuillets d’Hypnos de René Char. Il présente aussi Les Paravents de Jean Genet. Au Festival d’Avignon 2011, il monte Mademoiselle Julie d’August Strindberg avec notamment Juliette Binoche. En 2013, il y met en jeu Corps... d’après le roman d’Alexandra Badea.

Il met en scène des opéras, contemporains ou classiques, Forever Valley en 2000, suivi par Kyrielle du sentiment des choses, Agrippina, et Shadowtime. Il est également interprète de 2005 à 2012 dans Hippolyte de Robert Garnier, Phèdre de Racine, en 2009,  et dans Images latentes en 2010. 
Il réalise un long métrage en 2007, La Pluie des prunes qui reçoit le Prix du meilleur film au Festival du film de Genève.

théâtre - mise en scène (depuis 2000)
2013 Corps... d’après le roman d’Alexandra Badea
2011 Mademoiselle Julie d’August Strindberg
2010 The descendents of the eunuq admiral de Kuo Pao Kun
Phèdre de Racine
2007 Les Feuillets d’Hypnos de René Char
Les Paravents de Jean Genet
2006 Gens de Séoul de Oriza Hirata
2005 Animal de Roland Fichet
2004 L’Illusion comique de Corneille
2003 Dors mon petit enfant de Jon Fosse
Cendres et lampions de Noëlle Renaude
Agrippine, livret de Vincenzo Grimani
2002 Les Paravents de Jean Genet
L’Annonce faite à Marie de Paul Claudel
2001 Bérénice de Racine co-dirigé avec Bernardo Montet
2000 Tokyo Notes de Oriza Hirata